1. ２本鎖DNA
   1. ポックスウイルス科(Poxvirisae)
      1. チョドポックスウイルス亜科(Chordopoxvirinae)
         1. 痘瘡ウイルス(Variola virus)
         2. サル痘ウイルス(Monkeypox virus)
         3. ワクシニアウイルス(Vaccinia virus)
      2. その他(other)
         1. 伝染性軟属腫ウイルス(Molluscum contagiosum virus)
   2. ヘルペスウイルス科(Herpesviridae)
      1. アルファヘルペスウイルス亜科(Alphaherpesviridae)
         1. 単純ウイルス属（Simplexvirus）
            1. 単純ヘルペスウイルス１型(HSV-1)
            2. 単純ヘルペスウイルス２型(HSV-2)
         2. 水痘ウイルス属(Varicellovirus)
            1. 水痘・帯状疱疹ウイルス(VZV)
      2. ベータヘルペスウイルス亜科(Beataherpesviridae)
         1. サイトメガロウイルス属(Cytomegalovirus)
            1. サイトメガロウイルス(CMV)
         2. ロゼオロウイルス属(Roseolovirus)
            1. ヒトヘルペスウイルス６型(HHV6)
            2. ヒトヘルペスウイルス７型(HHV7)
      3. ガンマヘルペスウイルス亜科(Gammaherpesviridae)
         1. リンホクリプトウイルス属(lymphocryptovirus)
            1. EBウイルス(EBV)
         2. ラディノウイルス属(Rhadinovirus)
            1. カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス(KSHV)
   3. アデノウイルス科(Adenoviridae)
      1. マストアデノウイルス属(Genus:Mastadenovirus)
         1. ヒトアデノウイルス(Human adenovirus)
   4. パピローマウイルス科(Papillomaviridae)
      1. パピローマウイルス属(Genus papillomavirus)
         1. ヒト乳頭腫ウイルス(Human papillomavirus:HPV)
   5. ポリオーマウイルス科(Polyomaviridae)
      1. ポリオーマウイルス属(Polyomavirus)
         1. BKポリオマーウイルス(Polyomavirus BK)
         2. JCポリオーマウイルス(Polyomavirus JC)
2. １本鎖DNA
   1. パルボウイルス科(Parvoviridae)
      1. エリスロウイルス属(Erythrovirus)
         1. パルボウイルス B19(Parvovirus B19)
      2. ディペンドウイルス属(Dependovirus)
         1. アデノ随伴ウイルス(Adeno-associated virus)
3. ２本鎖RNA
   1. レオウイルス科(Reoviridae)
      1. オルソレオウイルス属(Orthoreovirus)
         1. レオウイルス(Reovirus)
      2. ロタウイルス属(Rotavirus)
         1. ロタウイルス(Rotavirus)
      3. コルチウイルス属(Coltivirus)
         1. コロラドダニ熱ウイルス(Colorado tick fever virus)
4. ２本鎖DNA逆転写
   1. ヘパドナウイルス科(Hepadonaviridae)
      1. B型肝炎ウイルス(Hepatitis B virus)
5. １本鎖RNA+鎖
   1. ピコルナウイルス科(Picornaviridae)
      1. エンテロウイルス属(Enterovirus)
         1. ポリオウイルス(Poliovirus)
         2. コサッキーウイルス(Coxackie virus)
         3. エコーウイルス(Echovirus)
         4. エンテロウイルス(Enterovirus)
      2. ライノウイルス属(Rhinovirus)
         1. 風邪ウイルス(Rhinovirus)
      3. ヘパトウイルス属(Hepatovirus)
         1. A型肝炎ウイルス(Hepatitis A virus)
   2. カリシウイルス科(Caliciviridae)
      1. ノロウイルス属(Norovirus)
         1. ノーウォークウイルス(Norwalk virus:NV)
      2. サポウイルス属(Sapovirus)
         1. サッポロウイルス(Sapporo virus:SV)
   3. アストロウイルス科(Astroviridae)
      1. ママストロウイルス属(Genue:Mamastrovirus)
         1. ヒトアストロウイルス(Human astorovirus:HAstV)
   4. コロナウイルス科(Coronaviridae)
      1. コロナウイルス属(Coronavirus)
         1. SARSコロナウイルス(SARS-CoV)
   5. トガウイルス科(Togaviridae)
      1. アルファウイルス属(Alphavirus)
         1. 頭部ウマ脳炎ウイルス(EEEV)
         2. 西部ウマ脳炎ウイルス(WEEV)
         3. ベネズエラウマ脳炎ウイルス(VEEV)
      2. ルビウイルス属(Rubivirus)
         1. 風疹ウイルス(Rubella virus)
   6. フラビウイルス科(Flaviviridae)
      1. フラビウイルス属(Flavivirus)
         1. 黄熱ウイルス(Yellow fever virus)
         2. デング熱ウイルス(Dengue fever virus)
         3. 西ナイル熱ウイルス(West Nile fever)
         4. 日本脳炎ウイルス(Japanese encephalitis virus)
      2. ヘパシウイルス属(Hepacivirus)
         1. C型肝炎ウイルス(Hepatitis C virus:HCV)
   7. ヘペウイルス属(Genus Hepevirus)
      1. E型肝炎ウイルス（Hepatitis E virus:HEV)
6. １本鎖RNA-鎖
   1. パラミクソウイルス科(Paramyxoviridae)
      1. パラミクソウイルス亜科(Paramyxovirinae)
         1. レスピロウイルス属(Respirovirus)
            1. ヒトパラインフルエンザウイルス1型(human parainfluenza virus 1)
            2. ヒトパラインフルエンザウイルス3型(human parainfluenza virus 3)
         2. ルブラウイルス属(Rubulavirus)
            1. ムンプスウイルス(Mumps virus)
            2. ヒトパラインフルエンザウイルス２型(human parainfluenza virus 2)
            3. ヒトパラインフルエンザウイルス4型(human parainfluenza virus 4)
         3. モルビリウイルス属(Morbillivirus)
            1. 痲疹ウイルス(Measles virus)
      2. ニューモウイルス亜科(Pneumovirinae)
         1. ニューモウイルス科(Pneumovirus)
            1. RSウイルス(Respiratory syncytial virus)
   2. ラブドウイルス科(Rhabdoviridae)
      1. リッサウイルス属(Lyssavirus)
         1. 狂犬病ウイルス(Rabies virus)
   3. フィロウイルス科(Filoviridae)
      1. エボラウイルス属(Ebola virus)
         1. エボラ出血熱ウイルス(Ebola virus)
      2. マールブルグウイルス属(Marburg virus)
         1. ビクトリア湖マールブルクウイルス(lake Victoria marbugvirus)
   4. ボルナウイルス科(Bornaviridae)
      1. ボルナウイルス属(Bornavirus)
         1. ボルナ病ウイルス(Borna disease virus:BDV)
   5. オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)
      1. A型インフルエンザ属(Influenzavirus A)
      2. B型インフルエンザ属(Influenzavirus B)
      3. C型インフルエンザ属(Influenzavirus C)
   6. アレナウイルス科(Arenaviridae)
      1. アレナウイルス属(LCM virus group)
         1. ラッサウイルス(Lassa virus)
   7. ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)
      1. ハンタウイルス属(Hantavirus)
         1. ハンターウイルス(Hantaan virus)
      2. ナイロウイルス属(Nairovirus)
         1. クリミア・コンゴ出血熱ウイルス(Crimean-Congo hemorrhagic fever virus)
7. １本鎖RNA逆転写
   1. レトロウイルス科(Lentivirinae)
      1. レンチウイルス亜科(Lentivirinae)
         1. レンチウイルス属(Lentivirus)
            1. ヒト免疫不全ウイルス(Human immunodeficiency virus:HIV)
      2. オンコウイルス亜科(Oncovirinae)
         1. C型オンコウイルス属(Type C oncovirus group)
            1. 成人T細胞白血病ウイルス(Human T-lymphotropic virus:HTLV-1)