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Problema
- Mapeo epidemiológico del genotipo al fenotipo
- Fenómenos que ocultan las causas subyacentes de las enfermedades comunes complejas
- Identificar subconjuntos más homogeneos de pacientes
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Heterogeneidad genética
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Heterogéneo
- Compuesto de partes de diversa naturaleza.
- Mayor problema
- Se refiere a la presencia de diferentes mecanismos genéticos subyacentes que resultan en la aparicion de un fenotipo de una misma enfermedad o similar
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Dos formas
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Heterogeneidad alélica
- Alelo
- Forma alternativa de un gen
- Cuando dos o más alelos de un mismo locus individual se asocian de forma independiente con el mismo rasgo
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Heterogeneidad de locus
- Locus
- Ubicación específica de un gen
- Se produce cuando dos o más variaciones de la secuencia de ADN en distintos loci se asocian independientemente con el mismo rasgo
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Epistasis
- Interacciones gen a gen
- Es un problema particularmente retador dado que la asociación de un gen a una enfermedad pude ser solamente vista en el contexto de al menos otro gen
- la acción de un gen se ve modificada por la acción de uno o varios genes
- Los enfoques convencionales, estadística y de análisis han sido incipientes en el problema
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Enfoque
- Uso de Sistemas clasificadores de lenguaje
- Tesis: Los algoritmos LCS son útiles para la detección, caracterización y modelado de GH
- Caracterización y modelado de una enfermedad, teniendo la presencia tanto de la heterogeneidad genética
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Uso de 3 versiones de Michigan
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XCS
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eXtended Classifier System
- Busca incrementar proliferación y rendimiento de los LCSs
- El más polular
- Es la base e inspiración de los otros dos
- Es flexible y muy aplicable a problemas como mineria de datos y clasificación
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UCS
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sUpervised Classifier System
- Reemplaza el refuerzo de aprendizaje por aprendizaje supervisado
- Fomenta la formación de conjuntos de reglas eficientes
- Altera la forma cde cálculo del fitness
- Clasificación y mineria de datos
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MCS
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Minimal Classifier System
- Muy simple
- Basado en fuerza
- Es la versión simplificada de XCS
- Poco aplicable en problemas del mundo real
- Teórico
- Usado para comparar otros estudios
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Conclusiones
- Puntos fuertes y débiles de los enfoques Michigan
- Sentar las bases para el desarrollo de un algoritmo LCS especifico para abordar la GH
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Particularidades
- Selección por torneo
- Tamaños de torneo proporcionales al tamaño del conjunto (0.5)