1. Alterazione nucleotidi
   1. Tipologie
      1. Sostituzioni
         1. Analoghi basi
         2. Agenti intercalanti
      2. Danni
         1. Rottura zucchero-fosfato
         2. Rottura legame N-glicosidico
         3. Modificazione base azotata
            1. Alchilazione
            2. Ossidazione
            3. Deaminazione
         4. Formazione legami crociati
      3. Mutazioni
         1. Silenti
         2. Missenso
         3. Non senso
         4. Scorrimento modulo di lettura
         5. Di allungamento
   2. Riparazione
      1. Escissione base
         1. 1. DNA glicosidasi -> rimuove base
         2. 2. AP endonucleasi -> rimozione nucleotide
         3. 3. DNA polimerasi
         4. 4. DNA ligasi
      2. Escissione nucleotide
         1. Procarioti
            1. 1. UvrA riconosce distorsione
            2. 2. UvrB esponde base
            3. 3. UvrC endonucleasi
            4. 8 a monte
            5. 4 a valle
            6. 4. UvrD elicasi
            7. 5. DNA polimerasi
            8. 6. DNA ligasi
         2. Eucarioti
            1. 1. XCP riconosce distorsione
            2. 2. XPB e XPD rottura legami ad H
            3. 7-8 a monte
            4. 2-3 a valle
            5. 3. XPF e XPG endonucleasi
            6. 4. DNA polimerasi
            7. 5. DNA ligasi
2. Singolo filamento
   1. 1. Riconoscimento
   2. 2. Endonucleasi taglia un legame
   3. 3. DNA polimerasi
   4. 4. Rimozione tratto errato
   5. 5. DNA ligasi
3. Doppio filamento
   1. Unione non omologa
      1. Error free
         1. 1. Ku70/Ku80 riconoscono
         2. 2. DNA PKCs modifica estremità
         3. 3. DNA ligasi IV risalda
      2. Error prone
         1. 1. Perdita nucleotidi
         2. 2. MRX digerisce estremità
         3. 3. DNA ligasi IV risalda
   2. Unione omologa
      1. 1. Complesso MRN riconosce
      2. 2. Digestione estremità
      3. 3. Formazione 3' ssDNA overhang
      4. 4. RPA lega ssDNA
      5. 5. Rad51 e Rad52 legano DSB (double strand break)
      6. 6. Riconoscimento regione omologa
         1. Cromatidio fratello integro
      7. 7. BRCA1, BRCA2, Rad51-like
         1. 1. Invasione doppia elica
         2. 2. Appaiamento molecole
         3. 3. Scambio filamenti
      8. 8. DNA polimerasi
      9. 9. DNA ligasi
4. Particolari
   1. Accoppiata alla trascrizione
      1. XPA-XPG
   2. Blocco replicazione
      1. Polimerasi translesione
         1. Bassa processività
         2. Profreeding
         3. Nucleotidi non complementari
   3. Fotoriattivazione
      1. Dimeri di timina
      2. Fotoliasi
5. Dimeri di Timina