Procarioti
1. Segnali di inizio
Pribnowbox
Esamero
2. Dna elicasi
3. Trascrizione abortiva
4. Allungamento
5. Terminazione
Rho-indipendente
Struttura a forcina
4 Uracili
Rho-dipendente
Struttura
6 subunitÃ
Meccanismo
1. Sito rut
2. Idrolisi ATP
3. Attività elicasica
Eucarioti
1. Sequenze consenso
TATA Box
GC box
CAAT box
2. TFIID
TBP (TATA box)
TAF (TATA less)
3. TFIIB
BRE
4.TFIIF
RNA polimerasi
Stabilizza
TBP
TFIIB
5. Trascrizione
Primi 12 nucleotidi
1. Allontanamento TFIIB e TFIIF
2. TFIIH
5' serina C-terminale
Capping
3. P-TEFb e CTKI
2' serina C-terminale
Splicing e poliadenilazione
6. Terminazione
Modificazioni post traduzionali
Capping
Funzioni
Protezione
Segnalazione
RIconoscimento
Meccanismo
RNA trifosfatasi
Guanilil transferasi
Metil-transferasi
Tailing
Sequenze
Segnale poliadenilazione
Sito di taglio -> CA
Sequenza riconoscimento sito di taglio -> CU e U
Meccanismo
1. CstF stimola
2. CPSF riconosce
3. CFI e CFII tagliano coda
4. PAP
5. PABP
Splicing
Sequenze
Sito accettore di splicing
Sito donatore di splicing
Sito di ramificazione
Sequenza polipirimidinica
Meccanismo
1. U1 riconosce donatore di splicing
2. Riconosce sequenza polipirimidinica
3. Complesso E
4. BBP -> U2 (sito di ramificazione)
5. Distorsione adenina
6. Formazione complesso A
7. Ingresso U4/U6 e U5
8. U4 allontanato
9. U1 allontanato
10. Riposizionamento U6 e U5 -> complesso C
11. Reazione trans-esterificazione U6
OH in C2 adenina
Fosfato in C5 guanina
12. U5 Reazione trans-esterificazione
Esone I
Esone II
Editing RNA
Inserzione
Uracili
Deaminazione
A-to-I
Recettore glutammato
Sito QR
Sito RG
C-to-U
Apoliproteina B
Fegato
Intestino
Altri RNA
rRNA
Metilazione C2 ribosio
Rotazione base azotata
tRNA
Taglio in 5'
Taglio in 3'
CCA
Splicing
Inserimento nucleotidi
Uridina
Di-idrouridina
ribotimidina