1. 單細胞動物（Protozoa）
   1. 原生動物門 Protozoa
2. 多細胞動物（即後生動物 Metazoa）
   1. 中生動物亞界 (Mesozoa)
      1. 直泳動物門 Orthonectida
      2. 菱形動物門 Rhombozoa
      3. 單胚動物門 Monoblastozoa
   2. 真後生動物亞界（Eumetazoa）
      1. 輻射對稱動物
         1. 刺胞動物門
         2. 櫛水母動物門
         3. 三裂(葉)動物門
      2. 兩側對稱動物
         1. 盾形動物門 Proarticulata †
         2. 後口動物 Deuterostomia
            1. 後口動物總門 Deuterostomia
            2. 無腔動物門 Acoelomorpha
            3. 異渦動物門 Xenoturbellida
            4. 棘皮動物門 Echinodermata
            5. 古蟲動物門 Vetulicolia
            6. 半索動物門 Hemichordata
            7. 脊索動物門 Chordata
         3. 原口動物 Protostomia
            1. 蛻皮動物總門 Ecdysozoa
            2. 動吻動物門 Kinorhyncha
            3. 鎧甲動物門 Loricifera
            4. 鰓曳動物門 Priapulida
            5. 線蟲動物門 Nematoda
            6. 線形動物門 Nematomorpha
            7. 葉足動物門 Lobopodia †
            8. 有爪動物門 Onychophora
            9. 緩步動物門 Tardigrada
            10. 節肢動物門 Arthropod
            11. 扁蟲動物總門 Platyzoa
            12. 扁形動物門 Platyhelminthes
            13. 腹毛動物門 Gastrotricha
            14. 輪形動物門 Rotifera
            15. 棘頭動物門 Acanthocephala
            16. 顎胃動物門 Gnathostomulida
            17. 微顎動物門 Micrognathozoa
            18. 環口動物門 Cycliophora
            19. 冠輪動物總門 Lophotrochozoa
            20. 軟舌螺動物門 Hyolitha †
            21. 紐形動物門 Nemertea
            22. 內肛動物門 Entoprocta
            23. 外肛動物門 Bryozoa
            24. 腕足動物門 Brachiopoda
            25. 帚蟲動物門 Phoronida
            26. 軟體動物門 Mollusca
            27. 環節動物門 Annelida
            28. 星蟲動物門 Sipuncula
3. 毛顎動物門 Chaetognatha